Ein Jahr nach Nyas Verwandlung kommen die Ninja wieder zusammen, um den Schmuggel von Tiefenstein zu untersuchen. Dabei müssen die Fünf auf die Hilfe von Aspheera setzen, die wegen ihnen im Kryptonischen Gefängnis sitzt. Zudem treffen sie auf die unbekannten neuen Ninja, die ihnen zunehmend den Schneid abzuverkaufen drohen. Im Hintergrund braut sich allerdings bereits eine viel größere und geheimnisvollere Gefahr auf... Nya versucht derweil, ihre alte Gestalt einzunehmen um zu ihren Freunden zurück zu kehren. Wird ihr das gelingen und wenn ja zu welchem Preis? Was hat es mit dem mysteriösen Diamantkönig auf sich und können unsere Helden ihre übermächtig erscheinende Aufgabe meistern?