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Beschreibung
Dieses Buch ist ein praktischer Ratgeber für Biologinnen und Biologen, die Multiple Sequenzalignments (MSAs) für ihre Datenanalysen verwenden und einen verständlichen Überblick über die vielen verschiedenen Programme suchen. Trotz ihres wichtigen Stellenwertes in der Datenanalyse herrscht Unsicherheit unter den Forschenden wie MSA-Programme genau funktionieren - ganz zu schweigen davon, wie und warum die unterschiedlichen Analysen zu verschiedenen Ergebnissen führen. Welches Programm ist für die Auswertung meiner Daten das richtige und wie kann ich sicherstellen, alle relevanten Erkenntnisse aus den Alignments gezogen zu haben? Dieses Buch bietet hilfreiche Erklärungen und Hintergründe ohne große bioinformatische Vorkenntnisse vorauszusetzen und führt die Leserinnen und Leser langsam in die Thematik ein.
Im ersten Teil des Buches werden die möglichen Einsatzfelder wie auch die Formate, die üblicherweise von MSA-Programmen produziert werden, im Detail beschrieben. Ebensowerden auf unkomplizierte Weise die zentralen Algorithmen sowie die inneren Abläufe der gängigsten MSA-Programme der Vergangenheit und der Gegenwart in größerer Detailtiefe erklärt. Den zweiten Teil des Buches bildet ein ausführlicher datenbasierter Vergleich zwischen MSA-Programmen, der als Entscheidungshilfe für die Programmauswahl für dein nächstes Alignment dienen soll.
Dieses Buch ist ein praktischer Ratgeber für Biologinnen und Biologen, die Multiple Sequenzalignments (MSAs) für ihre Datenanalysen verwenden und einen verständlichen Überblick über die vielen verschiedenen Programme suchen. Trotz ihres wichtigen Stellenwertes in der Datenanalyse herrscht Unsicherheit unter den Forschenden wie MSA-Programme genau funktionieren - ganz zu schweigen davon, wie und warum die unterschiedlichen Analysen zu verschiedenen Ergebnissen führen. Welches Programm ist für die Auswertung meiner Daten das richtige und wie kann ich sicherstellen, alle relevanten Erkenntnisse aus den Alignments gezogen zu haben? Dieses Buch bietet hilfreiche Erklärungen und Hintergründe ohne große bioinformatische Vorkenntnisse vorauszusetzen und führt die Leserinnen und Leser langsam in die Thematik ein.
Im ersten Teil des Buches werden die möglichen Einsatzfelder wie auch die Formate, die üblicherweise von MSA-Programmen produziert werden, im Detail beschrieben. Ebensowerden auf unkomplizierte Weise die zentralen Algorithmen sowie die inneren Abläufe der gängigsten MSA-Programme der Vergangenheit und der Gegenwart in größerer Detailtiefe erklärt. Den zweiten Teil des Buches bildet ein ausführlicher datenbasierter Vergleich zwischen MSA-Programmen, der als Entscheidungshilfe für die Programmauswahl für dein nächstes Alignment dienen soll.
Über den Autor
Theodor Sperlea studierte in Marburg Biologie und Molecular and Cellular Biology mit einem Schwerpunkt in Mikrobiologie und Genetik. Früh im Studium hatte er erste Kontaktmöglichkeiten mit MSAs als Werkzeug zur Untersuchung von evolutionären Verhältnissen zwischen Genen verschiedener Organismen. Durch seine Promotion, in der er die Ökologie von Mikroorganismen in Seen mit statistischen und bioinformatischen Methoden untersucht hat, konnte er sich einen tieferen Einblick in die informatische Seite und somit die Funktionsweise von MSA-Programmen erarbeiten.
Zusammenfassung

bietet praktische Hilfestellung bei der Entscheidungsfindung für Multiple Sequenzalignment Programme

auch ohne bioinformatische Kenntnisse zu verstehen

listet die gängigen Formate und Einsatzfelder von MSA-Programmen

Includes supplementary material: [...]

Inhaltsverzeichnis
I Hintergründe.- 1 Multiple Sequenzalignments: eine Einführung.- 2 Wie funktionieren MSA-Programme?- 3 Übersicht aktueller MSA-Programme.- II Welcher MSA-Algorithmus ist passend für mich?- 4 Details zur Analyse der Programme.- 5 Entscheidungshilfe.- Glossar.- Literatur.- Index.
Details
Erscheinungsjahr: 2019
Fachbereich: Allgemeines
Genre: Biologie, Mathematik, Medizin, Naturwissenschaften, Technik
Rubrik: Naturwissenschaften & Technik
Medium: Taschenbuch
Inhalt: xii
102 S.
13 s/w Illustr.
11 farbige Illustr.
102 S. 24 Abb.
11 Abb. in Farbe.
ISBN-13: 9783662588109
ISBN-10: 3662588102
Sprache: Deutsch
Herstellernummer: 978-3-662-58810-9
Einband: Kartoniert / Broschiert
Autor: Sperlea, Theodor
Auflage: 1. Auflage 2019
Hersteller: Springer Berlin
Springer Berlin Heidelberg
Verantwortliche Person für die EU: Springer Spektrum in Springer Science + Business Media, Tiergartenstr. 15-17, D-69121 Heidelberg, juergen.hartmann@springer.com
Maße: 235 x 155 x 7 mm
Von/Mit: Theodor Sperlea
Erscheinungsdatum: 18.06.2019
Gewicht: 0,189 kg
Artikel-ID: 115309978

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