Algorithms on Strings, Trees and Sequences

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Beschreibung

Describes a range of string problems in computer science and molecular biology and the algorithms developed to solve them.

Inhaltsverzeichnis

Part I. Exact String Matching: The Fundamental String Problem: 1. Exact matching: fundamental preprocessing and first algorithms; 2. Exact matching: classical comparison-based methods; 3. Exact matching: a deeper look at classical methods; 4. Semi-numerical string matching; Part II. Suffix Trees and their Uses: 5. Introduction to suffix trees; 6. Linear time construction of suffix trees; 7. First applications of suffix trees; 8. Constant time lowest common ancestor retrieval; 9. More applications of suffix trees; Part III. Inexact Matching, Sequence Alignment and Dynamic Programming: 10. The importance of (sub)sequence comparison in molecular biology; 11. Core string edits, alignments and dynamic programming; 12. Refining core string edits and alignments; 13. Extending the core problems; 14. Multiple string comparison: the Holy Grail; 15. Sequence database and their uses: the motherlode; Part IV. Currents, Cousins and Cameos: 16. Maps, mapping, sequencing and superstrings; 17. Strings and evolutionary trees; 18. Three short topics; 19. Models of genome-level mutations.

Erscheinungsjahr:	1997
Genre:	Informatik
Rubrik:	Naturwissenschaften & Technik
Medium:	Buch
Inhalt:	Gebunden
ISBN-13:	9780521585194
ISBN-10:	0521585198
Sprache:	Englisch
Ausstattung / Beilage:	HC gerader Rücken kaschiert
Einband:	Gebunden
Autor:	Gusfield, Dan
Hersteller:	Cambridge University Press
Maße:	260 x 183 x 34 mm
Von/Mit:	Dan Gusfield
Erscheinungsdatum:	01.05.1997
Gewicht:	1,228 kg

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